医院设有急诊科、重症医学科、内科、外科、骨伤科、妇产科、针灸推拿科、康复医学科、老年医学科、眼科、耳鼻喉科、麻醉科、营养科、治未病科、血液透析科、感染病科、介入科等28个病区及临床科室；设置有内、外、妇、儿、骨伤、针灸、推拿、口腔、五官、肛肠、皮肤等30余个常规门诊科室和脑病科、内分泌科、肿瘤科、肺病科、脾胃病科、心病科、肾病科、老年病科等8个内科专病门诊；设有影像科（放射科、核磁共振、CT室）、超声科、心电图室、胃（肠）镜中心、纤维支气管镜室、检验科、输血科、病理科、手术室、DSA导管室、中西药房、煎药室、中医特色护理门诊等17个医技科室，同时拥有3000多平方米的金寨县口腔医疗中心，面积达5000㎡的健康管理体检中心。

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